种质资源筛选保护
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品种的遗传背景是种质资源筛选、保种工作的重要评价指标。通过分子标记分析不同品种和群体的遗传多样性,可以为样本筛选、品种保存、群体研究提供参考与支持,是保种和种质筛选工作中的有效方法。
产品应用
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1、解析品种和群体的遗传背景,评价种群结构,为保种工作提供指导。
2、筛选保留全部遗传背景的核心种质资源,缩小品种选育和科学研究候选样本范围。
3、结合亲缘关系分析判断群体类型、划分家系、父本推测、完善系谱信息。
技术策略
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保种分析:每个群体10个样本以上,至少提供3个群体,样本应能代表该群体主要特征。
核心种质筛选:每个品种至少3个样本,尽可能收集某一范围内全部的种质资源。
测序策略:
WGS策略:测序深度推荐10X,超大基因组可适当降低深度
GBS策略:测序数据量需根据参考基因组大小确定,推荐10WTags/G,超大基因组可适当降低Tag数。
低深度重测序策略:1000样本以上,推荐测序深度1X及以上,单样本测序数据量不低于1G,可使用高深度测序数据填充。
液相芯片策略:推荐使用泛性状芯片进行测序。
技术路线
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