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基因分型

mapping ratio分布统计

  • 将各个样本的筛选后reads与sgRNA文库序列进行比对,统计各个样本中比对上sgRNA 文库的reads数目的占比。
不同分组样本统计得到的 sgRNA 进行标准化调整,以箱线图的形式对比 case/control 组或不同处理组之间的 sgRNA 差异。

sgRNA read counts分布图

  • 对各样本的sgRNA read counts的分布进行作图,sgRNA read counts 一般遵循泊松分布,该图可展示样本间read counts分布的差异。

差异基因富集分析

  • 根据 sgRNA 富集的 reads 支持数差异筛选出候选基因后,富集分析研究候选基因在 Gene Ontology 中的分布状况以期阐明实验中样本在候选基因功能上的体现。差异基因 GO 富集柱状图,直观的反映出在生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞组分(CC)富集的 GO term 上差异 sgRNA 基因的个数分布情况。

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