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UMI产品
1 动物组织
样本类型 | 送样量 | 样本保存和运输 | 注意事项 |
---|---|---|---|
动物组织 | 100mg | 寄送时将样本管放入更大的管或自封袋中,防止样本运输过程中被破坏,足量干冰运输,保证开箱验收时有足够干冰剩余。 | 选用新鲜采集的样品送样。采样时应选取核酸含量较多的部位(如动物的肝脏等组织)。 |
动物组织处理方法: (1)从动物活体取材获得组织后,快速用预冷的RNase-free水进行漂洗,去除血渍和污物,并剔除结缔组织和毛发等非研究组织。 (2)组织样品处理及切割过程应在冰上快速进行,时间过长会导致样品RNA降解。组织样品离开活体后,请在3min内完成组织取样及液氮速冻。样品离开活体/或者原生长环境后,样品中的内源酶即会开始降解RNA,降解速度与内源酶含量及温度有关。 (3)抑制内源酶活性的方法:A.立即加入裂解液,迅速匀浆。B.切成小块后立即投入液氮冷冻。这两个办法都要求操作快速。前者只适合细胞及内源酶含量较低的并且较容易匀浆的组织;后者适合所有的样品,通常,肝脏、胸腺、胰腺、脾脏、脑、脂肪、肌肉组织选择后者。 (4)体积较大的组织样品离开活体后需要快速分割成50-100mg的小块,液氮速冻后放入预冷的RNase-free带螺旋帽的2.0ml的EP管/冻存管中(请不要将样品直接保存于密封袋或不带螺纹旋盖的EP管中,因密封袋经过液氮速冻后变脆易破裂,易导致样品交叉污染,不带螺纹旋盖的EP管容易渗入液氮,导致管内体积膨胀爆管),封口膜封口,立即-80°C保存。 (5)动物组织样品如果使用RNAlater类的商业组织RNA保护试剂保存组织样品,请严格按照相关产品的说明书进行操作,取材时使组织块保持在试剂要求的大小范围,以保证试剂充分渗透,以免引起降解。注意:厚度小于0.5cm的新鲜组织(半个黄豆粒大小)如果厚度大于0.5cm,先切薄浸入5-10倍体积的RNAlater中。若组织块过厚,RNAlater体积少,则组织浸透不充分,内部组织易降解。 (6)如果使用TRIzol裂解液保存送样,请务必先进行液氮研磨破碎,然后溶于TRIzol中,参考用量为20-50mg/mlTRIzol;组织样品切勿过量,组织块大小0.2cm-0.3cm(绿豆粒大小),避免组织块较大,裂解不充分,且在融化过程中发生内源降解。注意:TRIzol保存的组织、细胞或研磨样,需要完成室温裂解10min后,在-80°C低温冻存,防止裂解不充分发生降解。 (7)样品采集时请将样品按照一次提取的量进行分管保存,避免提取时由于二次分管和并管引起样品降解。为确保实验的顺利,请将样品备份1-2份,以防备部分样品降解重新取材、制备或送样,耽误时间。 (8)肿瘤组织本身RNase较活跃,离体后请立即速冻、分割组织至约2-3mm厚,然后立即液氮速冻,速冻后放入预冷螺纹的RNase-free带螺旋帽的2ml的EP管/冻存管中,然后用封口膜封口,立即-80°C保存。若没有液氮速冻条件,可放入预装有RNAlater(RNA组织保存试剂)的2.0ml RNase-freeEP管中,用封口膜封口。请严格按照相关产品的说明书进行操作,取材时使组织块保持在试剂盒要求的大小范围,并按说明书要求保存。 |
2 植物组织
样本类型 | 送样量 | 样本保存和运输 | 注意事项 |
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植物组织 | 150mg | 寄送时将样本管放入更大的管或者自封袋中,防止样本运输过程中被破坏,并用大体积干冰运输,保证不朽情缘开箱验收时有足够干冰剩余。 | 选用新鲜采集的样品,采集样品时应选取核酸含量较多的部位(如植物的幼嫩部位) |
植物组织处理方法: (1)植物样品采集时快速用RNase-free水擦拭或冲洗干净,再用吸水纸吸干样品表面。 (2)组织样品处理及切割过程应在冰上尽可能快速进行,将样本分割成100mg左右的小块,时间过长会导致样品RNA降解。组织样品离开活体后,请将在3min内完成组织取样。样品离开活体/或者原来的生长环境后,样品中的内源酶即会开始降解RNA,降解速度与内源酶含量及温度有关。 (3)抑制内源酶活性的方法:A.立即加入裂解液,迅速匀浆;B.切成小块之后立即投入液氮速冻。这两个步骤都要求操作迅速。前者只适合细胞及内源酶含量较低的且较容易匀浆的组织;后者适用所有的样本,通常,植物组织选择后者。 (4)植物组织样品采集后,立即液氮速冻,并放入预冷的15/50ml离心管中(请勿将样品直接保存于密封袋,因密封袋经过液氮速冻后变脆易破裂,易导致样品交叉污染),封口膜封口,立即-80°C保存。 (5)不使用RNAlater等RNA保护试剂保存植物组织样品,因为一般植物细胞含有细胞壁,RNA保护试剂很难渗透到细胞中(具有自然屏障防止扩散的植物如蜡表皮的叶组织需要先破坏其屏障,以允许RNAlater进入组织)。TRIzol方法并不适用于萃取大多数植物组织样品。 (6)样品采集时将样品按照一次提取的量进行分管保存,避免提取时由于二次分管和并管引起样品降解。为确保实验的顺利,请将样品备份1-2份,以防备部分样品降解重新取材、制备或送样,耽误时间。 |
3 细胞样本
样本类型 | 送样量 | 样本保存和运输 | 注意事项 |
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悬浮细胞 | 1×106个 | 寄送时将样本管放入更大的管或者自封袋中,防止样本运输过程中被破坏,并用大体积干冰运输,保证开箱验收时有足够干冰剩余。 | 细胞样品不要保存于RNAlater一类组织RNA保护试剂中送样。 |
贴壁细胞 | |||
悬浮细胞处理方法: (1)收集用PBS缓冲液快速洗一次,每5×106个细胞加入1mlTRIzol试剂,用一次性注射器进行反复抽打细胞直至看不见成团的细胞块,整个溶液呈清亮而不粘稠的状态;放入-80°C冰箱中保存。 |
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贴壁细胞处理方法: (1)用PBS缓冲液快速洗一次;按每10cm2培养面积(相当于六孔板一个孔或35mm直径培养皿)加1mlTRIzol试剂的比例加入TRIzol试剂; (2)用1ml枪头反复吹打,使TRIzol接触所有长有细胞的培养瓶表面,并进行充分消化;转移到RNase-free的1.5ml或2ml的离心管中,用一次性注射器进行反复抽打细胞直至看不见成团的细胞块,整个溶液呈清亮而不粘稠的状态,放入-80°C冰箱中保存。 (3)也可将细胞样本收集到离心管之后,去掉培养基,用PBS缓冲液快速清洗一次,然后离心去掉上清,不加裂解液,直接液氮速冻,放入-80°C冰箱中保存。 (4)采样时按照一次提取的量进行分管保存,避免提取时由于二次分管和并管引起样品降解。为确保实验的顺利,请将样品备份1-2份,以防备部分样品降解重新取材、制备或送样。 |
4 菌体样本
样本类型 | 送样量 | 样本保存和运输 | 注意事项 |
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菌体 | 1×106个 | 寄送时将样本管放入更大的管或者自封袋中,防止样本运输过程中被破坏,并用大体积干冰运输,保证不朽情缘开箱验收时有足够干冰剩余。 | 不接收TRIzol裂解液送样,TRIzol直接保存菌体细胞,无法有效裂解细胞膜,导致提取不成功。 |
菌体样本处理方法: (1)菌体样品请收集液体培养基中对数生长期的菌体。 (2)通过低速离心收集菌体并尽可能将培养基去除干净,收集于1.5/2mlEP管中,用封口膜封好后立即液氮速冻,于-80°C保存。 (3)菌体体积密度较小的样品不建议保存于RNAlater一类组织RNA保护试剂中送样,因为RNAlater密度较大,保存于RNAlater中的菌体不便于后续离心收集。 (4)样品采集时请将样品按照一次提取的量进行分管保存,避免提取时由于二次分管和并管引起样品降解。为确保实验的顺利,请将样品备份1-2份,以防备部分样品降解重新取材、制备或送样。 |
5 血液样本
样本类型 | 送样量 |
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全血 | 3 ml |
血细胞样品的制备(哺乳动物收集白细胞进行后续实验): (1)在已加入抗凝剂(因肝素会影响下游建库测序,请选用除肝素外的其它抗凝剂)的新鲜全血中加入等体积PBS(1×),充分混匀;缓慢转入另一已加入淋巴细胞分离液的离心管中,并使上述混合液处于淋巴细胞分离液液面之上(即两种液体不要混合,保留清晰的界面),20°C,3000g离心30min; (2)用移液器小心分离出白细胞层;用PBS(1×)清洗白细胞,离心回收白细胞,弃去上清;加入白细胞20倍体积的TRIzol试剂,用一次性注射器进行反复抽打细胞直至看不见成团的细胞块,整个溶液呈清亮而不粘稠的状态; (3)液氮速冻后放入干冰或-80°C冰箱中保存。 (4)寄送时将样本管放入更大的管或者自封袋中,防止样本运输过程中被破坏,并用大体积干冰运输,保证公司实验人员开箱验收时有足够干冰剩余。 |
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TRIzol法样品的制备(请用紫头管采集血液): (1)取15ml离心管1个,加入6ml TRIzol和2ml新鲜血液(TRIzol:血液=3:1),用移液器吹打几次以帮助裂解样品中的细胞。 (2)样品剧烈震荡混匀1-2min,直到絮状物全部溶解。 (3)室温孵育5min以使核蛋白体完全分解。 (4)将处理过的混合液分装到4个2ml冻存管中,写好编号。 (5)封口膜封存,-80°C冻存。注意:血液不宜保存在RNAlater中,因为它们蛋白含量过高,与RNAlater混合后易形成不溶的沉淀。 |
6 TotalRNA样本及其他医学样本
样本类型 | 送样量 | |
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TotalRNA | UMI-mRNA | UMI-smallRNA |
浓度大于10ng/μl总量大于400ng | 浓度大于20ng/μl总量大于200ng | |
RNAlater送样组织制备建议(特别是肿瘤组织样本,优先选择RNAlater): (1)组织离体后,尽可能在冰上快速分成小块,浸泡在5倍体积的RNAlater(RNA组织保存试剂)。 (2)充分浸泡后,-80°C保存,干冰运输。 (3)组织块直径最好介于1mm-5mm(介于小米粒至绿豆之间),过小不利于样本收集,过大保护液不能均匀地渗透到组织细胞;放入足够干冰寄送或者置于-80°C。 (4)RNAlater适用于肿瘤以及容易降解的组织部位送样,其他正常组织同样适用。 (5)如果是肿瘤样本,应尽可能准确地判定肿瘤组织和正常组织,如果有条件请根据冰冻切片报告的结果来判断要进行研究的取材部位。 (6)为确保实验的顺利,建议样本备份1-2份,以防样品降解重新取材、制备或者送样。 |
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TRIzol送样组织制备建议: (1)组织离体后,尽可能在冰上快速分成小块,浸泡于TRIzol中,冻存管或者离心管封口膜封好后送样; (2)组织块直径最好介于1mm-5mm(介于小米粒到绿豆之间),过小不利于样本收集,过大则保护液不能均匀渗透到组织细胞;放入足够干冰箱寄送或者置于-80°C保存。 (3)适用于培养或者收集的各种细胞以及组织的新鲜液氮研磨样;其他组织也同样适用。 |
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液氮冷冻送样组织制备建议: (1)组织取样前准备好足够的液氮和已经写好样本编号的冻存管(液氮速冻要充分)。 (2)迅速取下合适大小的新鲜组织部位,快速进行清洁等处理后,迅速浸没于液氮中。 (3)将组织样本从液氮取出放入准备好的预冷的冻存管中,再次将样本进行液氮速冻。 (4)放入足量干冰箱寄送或者置于-80°C保存。 (5)适用于足够新鲜且不易降解的组织部位取样,其他正常组织同样适用。 |
7 注意事项
组织提取由于受组织上下游处理条件和组织本身特性等诸多因素影响,RNA提取风险较大,较难保证RNA提取质量,请做好组织备份。8 样本打包及寄送建议
8.1 样本的打包
(1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。8.2 样本的名称标识
(1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:不朽情缘 京ICP备15007085号-1