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表观组测序

文库片段分布

样本细胞使用H3K4me2一抗,建库完成后使用Agilent 2100 Bioanalyzer进行文库分布检测,显示不同大小的
片段分布状况。

reads相对TSS位置的分布

检测H3K4me2的信号分布,对转录起始位点(Transcription Start Site, TSS)上下游3kb区域的CUT&Tag信
号进行统计。横坐标表示reads相对TSS的位置,纵坐标表示reads密度。

peak峰检出

对唯一比对的reads进行峰检分析(peak calling),并对峰的个数、宽度、分布等进行统计,反应peak峰的整
体分布情况,统计峰顶分布情况,模体分析(Motif search ) 。

GO富集分析

Gene Ontology(GO)是基因功能国际标准分类体系。对相关基因做GO富集分析,可以挖掘出差异peak相关
基因相关的生物学功能,细胞组成,生物学过程。

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