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基因组测序

宏基因组测序(三代)

代谢通路分析

通过KEGG基因功能注释,分析各样品中与关键功能相关的代谢通路中基因的分布情况,及其丰度情况,比较不同分组间关键代谢通路的差异。从功能基因及代谢通路的层面来说明对照样品的关键物质代谢路线及含量差异的原因。

组间功能差异分析

为了研究组间具有显著性差异的功能,从不同层级的功能相对丰度表出发,利用 Metastats 方法筛选具有显著性差异的功能,然后绘制箱形图,箱形图可直观清晰的展示差异功能在组间的丰度分布。

抗性基因分析

通过CARD数据库的注释,可以找到
抗生素抗性基因、以及作用机制等信息,
抗性基因Overview圈图可以从整体上观察各样品中抗性基因丰度占比
,更加直观的展示各抗性基因丰度的整体分布情况。

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